【综述】利用转录谱在小鼠和大鼠中鉴定附睾特异的转录子

Daniel S. Johnston, Terry T. Turner, Joshua N. Finger, Tracy L. Owtscharuk, Gregory S. Kopf, Scott A. Jelinsky（美国）

为了在附睾中发现新的避孕靶点，我们将小鼠附睾分成10个部分，大鼠附睾分成19个部分，利用Affymetrix全基因组芯片完成其转录表达谱。在小鼠和大鼠附睾转录组中共鉴定出17 096和16 360个转录本。通过与小鼠转录谱数据库22个组织的转录子比较发现有77个转录子是附睾特异的。通过RT-PCR来进一步分析其相对应的基因在21个组织中的表达情况。RT-PCR分析证明Defensin Beta 13是附睾特异表达的，还鉴定出两个基因仅在附睾和睾丸中表达。通过与大鼠转录谱数据库中21个其他组织的转录子比较发现大鼠 16 360个转录子中有110个是附睾特异的。62个转录子通过qPCR进一步分析，仅有Defensin 22（E3附睾蛋白）是附睾特异的。此外还有14个转录子在附睾中表达水平比其他组织高100倍以上。这些基因产物可能在附睾或精子的功能上发挥重要的作用，可以作为避孕靶点来近一步研究和确认。此研究结果可以在哺乳动物生殖遗传学（Mammalian Reproductive Genetics，MRG）数据库（http://mrg.genetics.washington.edu）中检索到。

关键词：大鼠；小鼠;附睾;转录谱;避孕;附睾特异性;附睾选择性