《亚洲男性学杂志》 2013; 15 (5): 594-602
《亚洲男性学杂志》 2013; 15 (5): 594-602 精子发生的生物信息学:基于蛋白质组学阐释男性生殖
Tao Zhou, Zuo-Min Zhou and Xue-Jiang Guo(中国)
无论是在基础研究还是临床研究中,蛋白质组学策略已经在男性生殖领域得到了广泛的应用。生物信息学方法在基于蛋白质组学的研究中不可或缺,常用于数据可视化、数据库构建和功能注释。本文主要探讨由定量或定性方法获得的基因列表的功能学注释,总结了公共的蛋白质组数据库和男性生殖相关的专业蛋白质组数据库。我们介绍了用于揭示数据潜在生物学意义的综合分析工具。并且,我们详细地描述了基因本体分析、通路分析和生物医学分析中与男性生殖相关的内容。我们阐述了精子发生相关生物信息学注释的一般流程:从单个基因功能到整体的生物学事件,再从生物学意义走向临床应用。近期发表的蛋白质组学研究也表明生物信息学方法能帮助我们发现针对精子运动的药物靶标、筛选睾丸癌基因。另外,我们还总结了与男性生殖相关的网络资源,这些资源可以用于研究精子发生的调控。
关键词:生物信息学,数据库,男性生殖,蛋白质组学,精子发生
此摘要文献来源: Tao Zhou, Zuo-Min Zhou and Xue-Jiang Guo. Bioinformatics for spermatogenesis: annotation of male reproduction based on proteomics. Asian J Androl 2013;15: 594-602. |